Nepalske reke lahko običajno razdelimo v tri kategorije (odvisno od vrste hrane). Prvi so reke, ki se napajajo s taljenjem ledenikov. Drugi so reke, ki izvirajo iz grebena Mahabharat. Spet drugi so različni potoki in reke, katerih izvor je na grebenu Sivalik.
Reka Bagmati
Bagmati poteka skozi dežele osrednjega Nepala in indijsko državo Bihar. Izvir reke je v gorah in nastane ob sotočju več neimenovanih potokov (približno 15 kilometrov od Katmandua).
Vode Bagmati so svete tako v hinduizmu kot v budizmu. Na bregovih reke je veliko hindujskih templjev.
Reka Barun
Barun poteka skozi vzhodna ozemlja osrednjega Nepala in je desni pritok reke Arun.
Izvir reke so ledeniki Berun, ki se nahajajo na gori Makalu. Glavna smer toka je vzhod in jugovzhod. Reka je del rečnega sistema Kosi, ki vključuje tako velike reke, kot so: Arun; Tamur; Sonce-Kosi; Indravati; Dudh Kosi; Bhola Kosi.
Reka Gandak
Reka teče skozi ozemlje Nepala in Indije. Gandak je ena izmed štirih največjih nepalskih rek. Izvir reke je v Himalaji, na sotočju dveh rek: Muztang Khola; Kyugoma Khola. V zgornjem toku se reka imenuje Kali-Gandak. Sotočje Gandaka je voda reke Ganges. Dolina reke je bila trgovska pot, ki je povezovala Indijo in Tibet.
Dolina reke Gandak je zanimiva tudi zato, ker deli Veliko himalajsko verigo na dva dela, ki poteka med dvema vrhovoma - Annapura in Daulagiri.
Reka Ghaghra
Ghaghra poteka skozi dežele treh držav - Nepala, Kitajske in Indije. Skupna dolžina toka je 950 kilometrov in to je najgloblji vodni tok, ki napaja velik Ganges.
Izvir reke se nahaja na ozemlju Tibetanske planote (južni del, območje jezera Manasarovar). Ghaghra je najdaljša in največja reka v Nepalu. Glavna vrsta hranjenja rek: v zgornjem toku je voda ledenikov in stopljen sneg; spodnji tok se napaja v obdobju doji. Reka je še posebej polnotočna spomladi in poleti. V tem letnem času so na Ghaghri možne hude poplave. Rečne vode se večinoma uporabljajo za namakanje.
Reka Dudh-Kosi
Ena od nepalskih rek, ki je ena najvišjih gorskih rek ne le v državi, ampak po vsem svetu. Izvir reke je jezero Gokyo. Nato se tok spusti v trakt Namche-Bazar, kjer se vode Dudh-Kosi združijo z drugo reko-Bhote-Kosi.
Reka je kot nalašč za rafting, vendar je treba upoštevati, da ta pot ni primerna za začetnike.
Reka Rapti
Rapti je reka v Nepalu in Indiji s skupno dolžino 600 kilometrov. Izvir reke je na ozemlju gorovja Sivalik.