Reke Mongolije izvirajo visoko v gorah. In večina jih je zgornji tok največjih rek v Sibiriji in na Daljnem vzhodu.
Reka Zheltura
Rečna struga poteka skozi ozemlje Burjatije (Rusija) in Mongolije. Zheltura je desni pritok reke Dzhida. Izvir reke je v deželah Mongolije. Skupna dolžina rečnega kanala je 202 kilometrov in skoraj vsi gredo skozi ozemlje države. Rusija predstavlja le 18 kilometrov rečnega toka.
Reka prejme večji del vode med dežjem. Visoka voda se pojavi poleti, ko Mongolija prejme veliko padavin. Na ustju reke sta vasi Zheltura in Tengerek (Burjatija). Vode reke se aktivno uporabljajo kot vir pitne vode.
Reka Menza
Lokalni prebivalci reko imenujejo Minzhiin-Gol. Geografsko gledano kanal teče skozi Mongolijo in Rusijo ter je levi pritok reke Chikoy. Menza izvira na grebenu Baga-Khentai (Mongolija). Ko se spušča iz gora, gre skozi ozemlje Transbajkalskega ozemlja in se spet vrača iz Mongolije. Skupna dolžina rečnega kanala je 337 kilometrov.
Reka je okrog druge polovice novembra prekrita z ledom. Ledenje se začne konec aprila. Skupno trajanje zamrznitve je od 145 do 180 dni. Pozimi reka zmrzne več kot 130 centimetrov. Reko naseljujejo: lenok, taimen, ostriž, burbot, lipan in som.
Reka Orkhon
Rečno korito teče popolnoma skozi ozemlje Mongolije in ima dolžino 1124 kilometrov. Orkhon je druga najdaljša reka v Mongoliji.
Izvir reke se nahaja v gorah Khangai. Zgornji tok reke teče po ozki kanjonski dolini. Zgornji tok Orhona tvori precej visok (20 metrov) in širok (10 metrov) slap. Srednji tok reke poteka skozi globoko vijugavo dolino in šele ko zapusti gore, se reka razširi na 150 metrov. Orkhon je od novembra do aprila pokrit z ledom.
V dolini reke je veliko zanimivih krajev za obisk: Khara -Balgas - starodavno mesto, ki je bilo glavno mesto ujgurske države; Karakorum je glavno mesto mongolskega cesarstva. Poleg tega so v dolini reke našli več hunskih grobnic.
Reka Egiin-Gol
Reka teče skozi ozemlje Mongolije. Njegova skupna dolžina je 475 kilometrov. Izvir reke so vode jezera Khubsugul. Nato Egiin-Gol počasi nosi svoje vode v oddaljeno Selengo. Od oktobra do konca aprila je reka pokrita z ledom in postane privlačno mesto za ljubitelje zimskega ribolova. Tu jih najdemo - lipan, lenok, taimen. V svojem srednjem toku se reka razcepi na številne veje.