Na ozemlju države je 8.400 rek različnih dolžin. Hkrati se vse azerbajdžanske reke izlivajo v vode Arakov ali Kure.
Reka Alazani (Alazan)
Alazanski kanal teče skozi vzhodne dežele Gruzije in zahodni del Azerbajdžana. Del struge služi kot naravna meja med državama. Skupna dolžina kanala je 351 kilometrov. Poleg tega je reka največji pritok Kure.
Izvir Alazani se nahaja na pobočjih Velikega Kavkaza (njegov južni del). Glavni pritok Alazanija je reka Katekhchay. V svojem zgornjem toku je klasična gorska reka z burnim tokom. Ko njene vode pritečejo v prostorno dolino Kakheti, postane bolj mirno.
Vode reke se aktivno uporabljajo za namakanje. Dolina Alazani je glavno območje, kjer pridelujejo grozdje za vinarstvo.
Reka Turianchay (Tyuryan)
Turianchay je reka, od izvira do mesta sotočja, ki se v celoti nahaja na ozemlju države. Kanal poteka skozi štiri regije Azerbajdžana: Gabala; Ujar; Agdash; Zardabsky.
Izvir reke se nahaja na pobočjih Velikega Kavkaza (južni del). In to je sotočje dveh rek - Karachay in Agrichai. Turianchai se skozi umetno ustvarjen kanal pretaka v Kuru. Skupna dolžina reke je 180 kilometrov. Vzvodno je nevihtno. V bistvu se vode reke uporabljajo za namakanje.
Reka Aghstafa
Rečno strugo poteka skozi dežele Armenije in Azerbajdžana ter je desni pritok Kure. Skupna dolžina toka je 133 kilometrov.
Izvir reke se geografsko nahaja v Armeniji (zahodno pobočje gore Tezhler, greben Pambak). Zgornji tok Agstafe poteka po ozki soteski. Srednji in spodnji del kanala tečeta po široki dolini.
Vode Agstafe se aktivno uporabljajo za namakanje vinogradov, ki se nahajajo ob njenih bregovih. Glavni pritoki so: Bldan; Sarnajur; Voskepar; Agdan; Getik. Na bregovih reke so tri mesta - Dilijan; Ijevan; Kazahstanski. Dolina reke je nekoč služila kot trgovska pot. In danes si lahko ogledate izvire, okrašene s starodavnimi kamnoseki.
Reka Aker
Aker je levi pritok Arakov. Reka se začne na ozemlju Karabaškega višavja, kjer nastane ob sotočju dveh rek - Gochazsu in Shalva. Zgornji tok reke se prebija skozi vulkanske skale, ki tečejo skozi globoko in ozko sotesko. In šele na sredini se kanal razširi.
Reka se napaja s taljenjem snega, do obnove pa pride tudi zaradi dežja. Glavna uporaba rečnih voda je namakanje. Visoko vodo na Akerju opazimo maja-junija.